台灣民眾黨因總統大選期間政治獻金漏報、誤報，引發外界關注。經過多日查帳，民眾黨定調此事件為「沒有進入任何私人口袋」的烏龍，並非涉及「汙錢」，黨主席柯文哲也公開承認犯下「低級錯誤」，向支持者道歉。柯文哲將責任歸咎於會計師端木正的「便宜行事，調節帳目」，並將時任總幹事黃珊珊與財務長李文宗送中評會進行黨紀評議。然而，此舉仍無法平息爭議，讓民眾黨信譽受到重創，柯文哲更坦言感受到被民進黨圍剿的壓力。

儘管黨內舉行了記者會澄清，但主其事的會計師端木正並未出席，引發質疑。隨後，端木正發表聲明強調「均依法令規定，相信監察院、檢察署可還清白」，顯示他不願替民眾黨揹黑鍋。隨著民眾黨對端木正提告，監察院與北檢也決定對此案展開深入調查，並搜索柯辦與端木正辦公室，顯示司法機關正加緊追查柯文哲的責任。

民眾黨近期風波不斷，繼民眾黨籍新竹市長高虹安因助理費案被判貪汙停職後，柯文哲在擔任台北市長期間的京華城容積放寬案、萬大果菜市場改建案及北市科地上權案均遭質疑有圖利之嫌，並被市議員與民眾告發。其中，北檢已約談前副市長彭振聲，並限制其出境。外界猜測，下一步或將直接約談柯文哲，甚至可能對他採取強制措施。

在假帳爭議中，外界還發現民眾黨曾支付「木可公關公司」新台幣1300萬元授權金，而負責人李文娟則是李文宗介紹「找來幫忙」的對象。民眾黨在記者會上也宣布木可公司將停止運作，等同於承認該公司是「無黨營事業之名，有黨營事業之實」的「柯系公司」。此外，民眾黨推動「小草咖啡廳」計劃時，柯文哲的妻子陳珮琪以兒子名義開設公司，後因被檢舉，陳珮琪被迫承認「有犯意但無犯行」，但仍無法擺脫外界對柯文哲「家天下」的質疑。

有評論認為，民進黨此時針對柯文哲出手，並非意在將民眾黨徹底打垮，而是維持三足鼎立的局勢，以確保民進黨在選舉中的優勢。過去民進黨曾支持親民黨參選，目的就是分化藍營選票，對民眾黨的策略也是相同。然而，柯文哲一再表達對2028年的雄心，且民眾黨在年輕選票上的吸引力讓民進黨感到威脅。賴清德已將強化青年認同列為重點，並在選戰中積極爭取年輕選民支持。

歷史上，台灣政治舞台曾出現多個第三勢力，如親民黨、台聯黨及時代力量，但最終因領導人操守問題及黨內矛盾而逐漸消失。如今，民眾黨面臨相似挑戰，若柯文哲因政治獻金案垮台，民眾黨可能步上親民黨後塵，逐漸衰亡。

當三黨政治結構崩解，民眾黨的支持者可能將尋求新歸宿。民進黨已開始釋出「回頭草」的訊號，而國民黨也隨時準備接手搶票。最終，哪個政黨能夠說服民眾黨的支持者，將取決於其論述能力與吸引力，而在這方面，民進黨顯然比國民黨更具優勢。